一、合同协议可以作为税务举报证据吗

可以。
根据《国家税务总局令》第24号第十条的相关规定，实名检举和匿名检举均须受理。检举人应当至少提供被检举人的名称或者姓名、地址、税收违法行为线索等资料。
检举人检举税收违法行为应当实事求是，对提供检举材料的真实性负责，不得诬陷、捏造事实。税务举报需要的证据越详细越好，包括账册凭证、合同协议、发票收据、销售收入的报表和记账凭证、会计凭证、财务会计报表、纳税申报表及其他的纳税资料原件复印件。
《民事诉讼法》第六十三条 证据种类

证据包括

（一）当事人的陈述;

（二）书证;

（三）物证;

（四）视听资料;

（五）电子数据;

（六）证人证言;

（七）鉴定意见;

（八）勘验笔录。证据必须查证属实，才能作为认定事实的根据。

引用法规
[1]《国家税务总局令》 第24号第十条
[1]《民事诉讼法》 第六十三条

二、合同协议能够作为税务举报证据吗

合同协议可以作为税务举报证据。检举人检举税收违法行为应当实事求是，至少提供被检举人的名称或者姓名、地址、税收违法行为线索等资料，对提供检举材料的真实性负责。

三、税务行政复议优先办理可行吗，行政复议是行政诉讼的必经程序吗

1、对在税务案件处理过程中，同时涉及行政复议和刑事侦查、审判程序时，行政程序和刑事程序哪个程序优先的问题，目前尚无明确的法律法规。根据《中华人民共和国税收征收管理法》、《行政复议条例》及《税务行政复议规则》的法规，当事人对税务机关作出的征税行为不服提起行政复议，复议申请符合法定条件的，复议机关应当受理。

2、税务机关在处理此类案件时，应加强与公、检、法机关的工作联系与协调。

四、分公司可以进行独立报税吗，有何规定

如果总公司和分公司在同一个管辖权的，分公司不需要单独报税，由总公司统一报税；如果不在同一地区，那么按照属地原则，分公司要单独在其所在地进行报税。公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。
《公司法》第14条，公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。公司可以设立子公司，子公司具有法人资格，依法独立承担民事责任。

引用法规
[1]《公司法》 第14条